內分泌新陳代謝科專科指導醫師需具備以下資格：
(一) 初次擔任內分泌新陳代謝科專科指導醫師者，必須取得內分泌新陳代謝專科醫師滿兩年以上 ，且於本學會雜誌（Formosan Journal of Endocrinology and Metabolism）或相關SCI雜誌， 至少刊登一篇為第一作者或通訊作者之原著論文。
(二) 已取得內分泌新陳代謝科專科指導醫師資格者，必須在六年內於本學會雜誌（Formosan Journal of Endocrinology and Metabolism）或相關SCI 雜誌，至少刊登一篇為第一作者或通 訊作者之原著或綜論類論文，唯已取得教育部部定助理教授以上資格者不在此限。